2000년대
| 기관코드 | 기관명 | 존립기간 | 존폐여부 |
|---|---|---|---|
| 6500280 | 제주특별자치도 국제자유도시본부 | 2008-03-05 ~ | 존재 |
| 6500046 | 제주특별자치도 국제자유도시추진국 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500131 | 제주특별자치도 남부보건소 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500073 | 제주특별자치도 농업기술원 | 2006-07-01 ~ | 존재 |
| 6500321 | 제주특별자치도 도로관리사업소 | 2008-03-05 ~ | 존재 |
| 6500398 | 제주특별자치도 도립미술관 | 2009-06-25 ~ | 존재 |
| 6500282 | 제주특별자치도 도시건설방재국 | 2008-03-05 ~ 2011-01-18 | 폐지 |
| 6500060 | 제주특별자치도 도시건설본부 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500001 | 제주특별자치도 도지사 | 2006-07-01 ~ | 존재 |
| 6500320 | 제주특별자치도 동물위생시험소 | 2008-03-05 ~ | 존재 |
| 6500207 | 제주특별자치도 동물위생연구소 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500378 | 제주특별자치도 동부소방서 | 2008-09-01 ~ | 존재 |
| 6500276 | 제주특별자치도 문화관광교통국 | 2008-03-05 ~ 2011-01-18 | 폐지 |
| 6500022 | 제주특별자치도 문화관광스포츠국 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500318 | 제주특별자치도 문화진흥본부 | 2008-03-05 ~ 2011-01-18 | 폐지 |
| 6500187 | 제주특별자치도 문화진흥원 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500194 | 제주특별자치도 민속자연사박물관 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500033 | 제주특별자치도 보건복지여성국 | 2006-07-01 ~ | 존재 |
| 6500083 | 제주특별자치도 보건환경연구원 | 2006-07-01 ~ 2008-03-05 | 폐지 |
| 6500091 | 제주특별자치도 보훈청 | 2006-07-01 ~ | 존재 |
